蔬菜需要充足的有机肥，不断供给蔬菜整个生育期所需的养分，是有利于蔬菜品质的提高。

农作物秸秆粉碎后加入速腐剂，堆垛，表面用泥封平，使发酵温度维持在25℃～45℃，一般25天左右即可沤制成肥。也可提前用EM原露堆肥发酵，每立方米粪肥用EM原露1公斤加0.5公斤红糖对水20公斤，搅匀后静置30分钟，再喷洒在半干的粪肥中，翻堆后用农膜包严发酵，温度以不超过45℃为宜。每亩日光温室蔬菜可深施腐熟的有机肥16-20立方米，分两次施入(次施入2/3，第二次施入1/3)，施后浇透水1次，以防止肥害烧根。3年以上的蔬菜田，当土壤pH值小于6时，每亩分两次施入80公斤石灰粉，浇水中和土壤;当土壤pH值大于7时，每亩分两次施入50公斤石膏粉，浇水中和土壤。

农作物秸秆和畜禽粪便是沤制有机肥的上等原料。